En este eje, la investigación se enfoca en campos disciplinares dirigidos al estudio de agentes infecciosos microbianos y parasitarios, su epidemiología e inmunopatogenia. Incluye las siguientes áreas temáticas:
- Biología Molecular Aplicada a Salud Pública y Animal
- Virología Animal
- Parasitología Animal
- Microbiología Animal
- Inmunología Animal
- Epidemiología y Análisis Estadístico en Salud Animal y Salud Pública